Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TM6SF2Q9BZW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM6SF2Q9BZW4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms