Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRNKL1Q9BZJ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRNKL1Q9BZJ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms