Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
YTHDF1Q9BYJ9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF1Q9BYJ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF1Q9BYJ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF1Q9BYJ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF1Q9BYJ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF1Q9BYJ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
YTHDF1Q9BYJ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms