Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL4Q9BYD3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MRPL4Q9BYD3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL4Q9BYD3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms