Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF3Q9BXJ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms