Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR4Q9BXB1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR4Q9BXB1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR4Q9BXB1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR4Q9BXB1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGR4Q9BXB1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGR4Q9BXB1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGR4Q9BXB1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR4Q9BXB1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms