Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM109Q9BVC6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM109Q9BVC6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms