Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNPY3Q9BT09 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNPY3Q9BT09 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms