Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CGRRF1Q99675 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGRRF1Q99675 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms