Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EYA3Q99504 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EYA3Q99504 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EYA3Q99504 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms