Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM209Q96SK2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM209Q96SK2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms