Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC85AQ96PX6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC85AQ96PX6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms