Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RDH12Q96NR8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms