Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BORCS6Q96GS4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BORCS6Q96GS4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BORCS6Q96GS4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms