Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP6Q96FZ7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP6Q96FZ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms