Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVB12AQ96EY5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVB12AQ96EY5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVB12AQ96EY5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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