Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPDL1Q96EA4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.2 ms