Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTERF3Q96E29 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTERF3Q96E29 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTERF3Q96E29 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms