Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUS1Q96E22 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUS1Q96E22 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms