Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC39Q96DD0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC39Q96DD0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms