Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf44Q96CB5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf44Q96CB5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms