Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RUNDC1Q96C34 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
RUNDC1Q96C34 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.3 ms