Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DHX58Q96C10 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX58Q96C10 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms