Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSC1Q92574 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC1Q92574 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms