Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF31Q8WWY3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPF31Q8WWY3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF31Q8WWY3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms