Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELQQ8TDG4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELQQ8TDG4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELQQ8TDG4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms