Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC8Q8TC99 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC8Q8TC99 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms