Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STAG3L4Q8TBR4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STAG3L4Q8TBR4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms