Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUP35Q8NFH5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP35Q8NFH5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms