Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCPH1Q8NEM0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCPH1Q8NEM0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCPH1Q8NEM0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms