Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIML1Q8N9V2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIML1Q8N9V2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIML1Q8N9V2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIML1Q8N9V2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIML1Q8N9V2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIML1Q8N9V2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIML1Q8N9V2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms