Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC24Q8N4L8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC24Q8N4L8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC24Q8N4L8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms