Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA13Q8N1Q1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CA13Q8N1Q1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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