Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLFN12Q8IYM2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLFN12Q8IYM2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN12Q8IYM2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms