Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
P3H3Q8IVL6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
P3H3Q8IVL6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
P3H3Q8IVL6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
P3H3Q8IVL6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms