Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRX1Q86UT6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRX1Q86UT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRX1Q86UT6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms