Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE3BQ7Z3V4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
UBE3BQ7Z3V4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms