Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP1Q7L576 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYFIP1Q7L576 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYFIP1Q7L576 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms