Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8DQ7L1W4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8DQ7L1W4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC8DQ7L1W4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms