Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRINP3Q76B58 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
BRINP3Q76B58 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
BRINP3Q76B58 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms