Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM43BQ6ZT52 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM43BQ6ZT52 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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