Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMBR1LQ6UX01 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LMBR1LQ6UX01 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMBR1LQ6UX01 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms