Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL17Q6TDP4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL17Q6TDP4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms