Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RGMBQ6NW40 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGMBQ6NW40 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGMBQ6NW40 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms