Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REP15Q6BDI9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REP15Q6BDI9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms