Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC102BQ68D86 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC102BQ68D86 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC102BQ68D86 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms