Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN13Q68D06 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN13Q68D06 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms