Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
EFCAB2Q5VUJ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
EFCAB2Q5VUJ9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
EFCAB2Q5VUJ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms