Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC38Q5VT99 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms