Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GKAP1Q5VSY0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GKAP1Q5VSY0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms